Метод МД подходит для множества классических задач (в механике есть основным, можно использовать в термодинамике и др.). Отличительной чертой МД есть тот факт, что для описания движения частиц применяется классическая механика. Силы межатомного взаимодействия можно представить в форме классических потенциальных сил (как градиент потенциальной энергии системы).